Lever i havet

Under tiden till havs uppehåller sig atlantstören framför allt kustnära på grunt vatten, majoriteten av de störar som fångats i havet har fångats grundare än 20 m. Vintertid kan arten företa relativt långa vandringar söderut till varmare områden, men det finns exempel från märkningsförsök i Kanada att de drar sig ut på djupare vatten där de uppehöll sig på relativt konstant djup (60−100 m) under en stor del av vintern. Majoriteten håller sig ganska nära ursprungsfloden, men det finns dokumenterade förflyttningar på upp till 3000 km. I havet består födan huvudsakligen av havsborstmaskar, kräftdjur, mollusker och bottenlevande fisk.